RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 INSP01308 110 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 TCRAP04437 139 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 MIFP14174 115 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 CRISP2P16562 243 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 LEPP41159 167 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF138P52744 262 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 UBE2G2P60604 165 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 BLOC1S1P78537 153 aa6.24□□□□□ -1.41
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CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 ATG101Q9BSB4 218 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.24□□□□□ -1.41
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CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.23□□□□□ -1.41
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CLSTN3-212ENST00000541770 FAM231CP0DMU5 169 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 GNG5P63218 68 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 CLLU1Q5K131 121 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.23□□□□□ -1.41
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CLSTN3-212ENST00000541770 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.23□□□□□ -1.41
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CLSTN3-212ENST00000541770 X6R8D5 127 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.22□□□□□ -1.41
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CLSTN3-212ENST00000541770 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 CCL20P78556 96 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR3DS1Q14943 382 aa6.22□□□□□ -1.41
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CLSTN3-212ENST00000541770 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 CST9LP1Q5W188 147 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.21□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 C7orf71A4D174 169 aa6.21□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 H7BYZ3 331 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLSTN3-212ENST00000541770 GNG13Q9P2W3 67 aa6.21□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 PSG8Q9UQ74 426 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.2□□□□□ -1.42
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CLSTN3-212ENST00000541770 J3KRW8 73 aa6.2□□□□□ -1.42
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CLSTN3-212ENST00000541770 LINC01587Q99440 93 aa6.2□□□□□ -1.42
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CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 TREM1Q9NP99 234 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00862A6NCI5 91 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 C16orf90A8MZG2 172 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 BCL2P10415 239 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR9Q5T870 116 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-212ENST00000541770 C11orf52Q96A22 123 aa6.19□□□□□ -1.42
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