RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 ZNF815PA8K554 130 aa8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 XGP55808 180 aa8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GFRALQ6UXV0 394 aa8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.4□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 FAM186AA6NE01 2351 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 NBR2O15453 112 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CLEC3BP05452 202 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 SRD5A1P18405 259 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 Q6Q795 121 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 RNF183Q96D59 192 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 M0R381 172 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 ADIPOQQ15848 244 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CFAP161Q6P656 301 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 NFE4Q86UQ8 179 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 NPBQ8NG41 125 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 Q8TAT8 98 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CCL17Q92583 94 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 MED13Q9UHV7 2174 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 ERCC8Q13216 396 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CTSZQ9UBR2 303 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 SNCGO76070 127 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 HLA-DMBP28068 263 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE2BQ13066 116 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE2EQ4V326 116 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 LY6LH3BQJ8 138 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 RHODO00212 210 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CD7P09564 240 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 ZNF575Q86XF7 245 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CARD19Q96LW7 228 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CITED1Q99966 193 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE12JA6NER3 117 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE7O76087 117 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE12FP0CL80 117 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE12GP0CL81 117 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE12IP0CL82 117 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 COX6B1P14854 86 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAGE4Q13068 117 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 CFHR4Q92496 578 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 RAX2Q96IS3 184 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 LINC01600Q96MT4 127 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GAS8-AS1O95177 125 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 MED14OSP0DP75 135 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 EFNA4P52798 201 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 TTC32Q5I0X7 151 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 GLMPQ8WWB7 406 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 TIMD4Q96H15 378 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-215ENST00000537304 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 IGHG4P01861 327 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 TRGV3P03979 118 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 P0DMU3 169 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 FAM231AP0DMU4 169 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 FAM231CP0DMU5 169 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 BAALCQ8WXS3 180 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 TMEM141Q96I45 108 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 DPM3Q9P2X0 92 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.34□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 TIMM23O14925 209 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A20O43772 301 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 TCL1BO95988 128 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-215ENST00000537304 IFITM1P13164 125 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms