RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.15	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	FXYD7	P58549	80 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	OR11H2	Q8NH07	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730		Q8TAT8	98 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	LINC01587	Q99440	93 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730		U3KQK5	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	LYST	Q99698	3801 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730		Q6AWC8	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730		Q86TA4	180 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	RAB19	A4D1S5	217 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	RGS13	O14921	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	LTA	P01374	205 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730		J3KRW8	73 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	GNG4	P50150	75 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	GCG	P01275	180 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	IFITM2	Q01629	132 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	IL17D	Q8TAD2	202 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	C16orf74	Q96GX8	76 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.08	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730		C9JCJ5	164 aa		11.08	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.08	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.08	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	CBY3	A6NI87	242 aa		11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	CENPW	Q5EE01	88 aa		11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	UQCC3	Q6UW78	93 aa		11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.07	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	CEBPG	P53567	150 aa		11.06	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	TDRG1	Q3Y452	100 aa		11.06	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.06	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	PARL	Q9H300	379 aa		11.06	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730		X6R8D5	127 aa		11.06	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.05	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.05	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	HTN1	P15515	57 aa		11.05	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.05	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.05	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	RETN	Q9HD89	108 aa		11.05	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	XKRY2	A2RUG3	117 aa		11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730		Q8NAQ8	132 aa		11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	C8orf49	Q96NF6	230 aa		11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	NAGK	Q9UJ70	344 aa		11.04	□□□□□ -0.64
BBS1-224	ENST00000534730	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64

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