RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534460.5

RCOR3-215, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 3

Gene RCOR3, Length 427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-215	ENST00000534460	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	LCN9	Q8WX39	176 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	PARP14	Q460N5	1801 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	MUC4	Q99102	2169 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460		B4DSR2	109 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	CRP	P02741	224 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	IL5	P05113	134 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	GYPB	P06028	91 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	LINC00032	P0C843	101 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	SPTSSA	Q969W0	71 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460		S4R3C0	116 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RCOR3-215	ENST00000534460	TCHH	Q07283	1943 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	ROMO1	P60602	79 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	DSCR8	Q96T75	97 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	MAP3K1	Q13233	1512 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	EML5	Q05BV3	1969 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	COLCA2	A8K830	154 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SNCG	O76070	127 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460		Q96M85	177 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	PLXNA2	O75051	1894 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	CHD1	O14646	1710 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	NDUFB6	O95139	128 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	MT-ATP8	P03928	68 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	IGLC1	P0CG04	106 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	IL7	P13232	177 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	MUCL1	Q96DR8	90 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	CYYR1	Q96J86	154 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	MGAM	O43451	1857 aa		3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SBF2	Q86WG5	1849 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460		A0A0J9YX75	114 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	C12orf73	Q69YU5	71 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	TSKU	Q8WUA8	353 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SDK2	Q58EX2	2172 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	NIN	Q8N4C6	2090 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	HMSD	A8MTL9	139 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460		E7EQL1	145 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	PROSC	O94903	275 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SNCA	P37840	140 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	KRTAP10-8	P60410	259 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	ZNF345	Q14585	488 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	BET1L	Q9NYM9	111 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	ABCC3	O15438	1527 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	PLA2R1	Q13018	1463 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	CACNA1D	Q01668	2161 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RCOR3-215	ENST00000534460	RBAKDN	A6NC62	111 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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