RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 CD5LO43866 347 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 PPP1R17O96001 155 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TRBV12-3P01733 135 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TNP2Q05952 138 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TDRG1Q3Y452 100 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZS46 218 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 ZNF738Q8NE65 137 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 DCANP1Q8TF63 244 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.71□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TMEM213A2RRL7 107 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 LINC01549A6NIU2 74 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 PRAC2D3DTV9 90 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 SCGB1D1O95968 90 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 ORM1P02763 201 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 HLA-DMBP28068 263 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 DDTP30046 118 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 PET117Q6UWS5 81 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 RCHY1Q96PM5 261 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 C16orf95Q9H693 158 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 PEMTQ9UBM1 199 aa5.7□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 C2orf70A6NJV1 201 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 K7EQG2 157 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 M0R2Z0 102 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 NXPH4O95158 308 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3-11P01762 117 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 NTF3P20783 257 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TSPOP30536 169 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 LEPP41159 167 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 RNF182Q8N6D2 247 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 Q8N976 141 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 Q8TAT8 98 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 DPF1Q92782 380 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 MRAP2Q96G30 205 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.69□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 A0A1B0GUS0 222 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 LINC00587B1AMM8 73 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 M0R381 172 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TCF21O43680 179 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 LEPROTL1O95214 131 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 C3orf79P0CE67 100 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 DEFA6Q01524 100 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 ERCC8Q13216 396 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TWIST1Q15672 202 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TM4SF20Q53R12 229 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 C20orf173Q96LM9 149 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 PRELID3AQ96N28 172 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 VAMP8Q9BV40 100 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 COL12A1Q99715 3063 aa5.68□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 LINC01619G3V211 115 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 G0S2P27469 103 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 CKS2P33552 79 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 KIR3DS1Q14943 382 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 FA2HQ7L5A8 372 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 PTH2Q96A98 100 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 RNF185Q96GF1 192 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 MDFIQ99750 246 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 C20orf78Q9BR46 151 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.67□□□□□ -1.5
PACS1-211ENST00000531298 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.67□□□□□ -1.5
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