RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 TCF24Q7RTU0 167 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 ATOH7Q8N100 152 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 DEFB123Q8N688 67 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 Q9H3A6 140 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 TECTAO75443 2155 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 VCANP13611 3396 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GUT8 65 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PGPA6NDG6 321 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
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SGCE-211ENST00000522045 CCL3L1P16619 93 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 CEACAM3P40198 252 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 CCL11P51671 97 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SEC11AP67812 179 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PDE6HQ13956 83 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZS92 163 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 U3KQK5 164 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC13O75165 2243 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SDK1Q7Z5N4 2213 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 USP34Q70CQ2 3546 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 TANC2Q9HCD6 1990 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 A0A096LNJ9 63 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
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SGCE-211ENST00000522045 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PPIAL4DF5H284 164 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 I3L2K1 104 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 K7EM74 188 aa3□□□□□ -1.93
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SGCE-211ENST00000522045 IGLV1-47P01700 117 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 ARMS2P0C7Q2 107 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PPIAL4FP0DN26 164 aa3□□□□□ -1.93
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SGCE-211ENST00000522045 KRTAP10-10P60014 251 aa3□□□□□ -1.93
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SGCE-211ENST00000522045 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 COTL1Q14019 142 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 MPV17L2Q567V2 206 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PSMG4Q5JS54 123 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 UFSP1Q6NVU6 142 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 RPRMLQ8N4K4 120 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 ZADH2Q8N4Q0 377 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 Q8N9L7 120 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 DEFB108BQ8NET1 73 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 OR4C5Q8NGB2 326 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 OR1N2Q8NGR9 330 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 OR10AG1Q8NH19 301 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 FAM57AQ8TBR7 257 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PIFOQ8TCI5 191 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 BLNKQ8WV28 456 aa3□□□□□ -1.93
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SGCE-211ENST00000522045 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 RNF5Q99942 180 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 LAMA1P25391 3075 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 MED13Q9UHV7 2174 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 MUC21A0A140T8X8 626 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 H3BRM9 83 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 K7EIM0 57 aa2.99□□□□□ -1.93
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