RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 IGSF23A1L1A6 192 aa11.16□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.16□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.16□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.16□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.15□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 NBEAP1P0C6P0 100 aa11.15□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF415Q09FC8 603 aa11.15□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 FHL2Q14192 279 aa11.15□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 FRZBQ92765 325 aa11.15□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF492Q9P255 531 aa11.15□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 E5RGE8 158 aa11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 SRIP30626 198 aa11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 XGP55808 180 aa11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 RAB32Q13637 225 aa11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 PRR9Q5T870 116 aa11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 A0A087WTM6 91 aa11.13□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 K7EP13 123 aa11.13□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.13□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 EVI2AP22794 236 aa11.13□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF138P52744 262 aa11.13□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 Q6ZQT7 251 aa11.13□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 OR51M1Q9H341 326 aa11.13□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.13□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 CSN1S1P47710 185 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 MUC21Q5SSG8 566 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 Q5VSD8 79 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 Q8TAT8 98 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 THAP6Q8TBB0 222 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 PAXXQ9BUH6 204 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 ALG5Q9Y673 324 aa11.12□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 K7EQD1 137 aa11.11□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP10-1P60331 282 aa11.11□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 IL15RAQ13261 267 aa11.11□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.11□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 ORM1P02763 201 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 OR10J4P0C629 311 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 SFTA3P0C7M3 94 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 GYPEP15421 78 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 SPXQ9BT56 116 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 KCNIP2Q9NS61 270 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 MDFICQ9P1T7 246 aa11.1□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 SSNA1O43805 119 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 GCSHP23434 173 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 NHLH2Q02577 135 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF266Q14584 549 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 FXYD5Q96DB9 178 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF479Q96JC4 524 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.09□□□□□ -0.63
ITGA3-211ENST00000508100 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 RBAKDNA6NC62 111 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 C9JCJ5 164 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 OR7C2O60412 319 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 CRYGDP07320 174 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 RANP62826 216 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 RASL10AQ92737 203 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 NMES1Q9C002 83 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 FAM229AH3BQW9 127 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 PSCAO43653 123 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 SIX6O95475 246 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 H2BFSP57053 126 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 Q6AWC8 147 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 NAGKQ9UJ70 344 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.05□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.05□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 MED28Q9H204 178 aa11.05□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.05□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 DIRC3C9JPN6 131 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 M0R2P5 195 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 PPT1P50897 306 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 HYLS1Q96M11 299 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-211ENST00000508100 HERC1Q15751 4861 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms