RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 IGSF23A1L1A6 192 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 K7EP13 123 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF138P52744 262 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 CRYBA4P53673 196 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 RAB32Q13637 225 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 C8orf49Q96NF6 230 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 VGLL1Q99990 258 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 OR51M1Q9H341 326 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 NUDT15Q9NV35 164 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF492Q9P255 531 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.22□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 E5RGE8 158 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 CSN1S1P47710 185 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF415Q09FC8 603 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 FHL2Q14192 279 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.21□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 EVI2AP22794 236 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 SRIP30626 198 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 NHLH2Q02577 135 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 IL15RAQ13261 267 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 PAXXQ9BUH6 204 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.2□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 A0A087WTM6 91 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 ORM1P02763 201 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 PRR9Q5T870 116 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 FRZBQ92765 325 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 SPXQ9BT56 116 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.19□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 RBAKDNA6NC62 111 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 OR10J4P0C629 311 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 XGP55808 180 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 RANP62826 216 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF266Q14584 549 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 MUC21Q5SSG8 566 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZQT7 251 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 THAP6Q8TBB0 222 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 MDFICQ9P1T7 246 aa8.18□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 K7EQD1 137 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 OR7C2O60412 319 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 GYPEP15421 78 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 Q8TAT8 98 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 RASL10AQ92737 203 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 FXYD5Q96DB9 178 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF479Q96JC4 524 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 C9JCJ5 164 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 SFTA3P0C7M3 94 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 GCSHP23434 173 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC32Q9BV29 185 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.16□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 CRYGDP07320 174 aa8.15□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.15□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP10-1P60331 282 aa8.15□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 Q6AWC8 147 aa8.15□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.15□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.15□□□□□ -1.1
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 DIRC3C9JPN6 131 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 PSCAO43653 123 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 TAS2R45P59539 299 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 Q5VSD8 79 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms