RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	EPDR1	Q9UM22	224 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	RYR2	Q92736	4967 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	CBY3	A6NI87	242 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	FAM74A7	A6NL05	159 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	C11orf94	C9JXX5	98 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024		F6UZH7	168 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024		K7EQM0	130 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TCRA	P04437	139 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	NMB	P08949	121 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	MUC21	Q5SSG8	566 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	CST9LP1	Q5W188	147 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TREM1	Q9NP99	234 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	RYR3	Q15413	4870 aa		7	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	LCE6A	A0A183	80 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	LYRM9	A8MSI8	78 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	SNURFL	B1AK76	121 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	SLC51B	Q86UW2	128 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TVP23C	Q96ET8	276 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00479	Q96M42	142 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	ATG101	Q9BSB4	218 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	NAGK	Q9UJ70	344 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	PSG8	Q9UQ74	426 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	PEX7	O00628	323 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	PAGE4	O60829	102 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	ATP5G3	P48201	142 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	GAGE7	O76087	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	LY6G6C	O95867	125 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV2-11	P01706	119 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	GAGE12F	P0CL80	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	GAGE12G	P0CL81	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	GAGE12I	P0CL82	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	PPT1	P50897	306 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CALD1-223	ENST00000496024	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024		F5H768	121 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	GCG	P01275	180 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	SULT1A2	P50226	295 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	RAB5C	P51148	216 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	CCL20	P78556	96 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024		Q6AWC8	147 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024		Q6ZTI0	123 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	GNG13	Q9P2W3	67 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	APLN	Q9ULZ1	77 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	GNRH2	O43555	120 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	ATP5G1	P05496	136 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	AKR1C3	P42330	323 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	SMUG1	Q53HV7	270 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CALD1-223	ENST00000496024	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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