RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495949.1

RALGAPB-208, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 3

Gene RALGAPB, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-208	ENST00000495949	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		H3BTX0	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	PEX7	O00628	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TSPAN4	O14817	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	AKR1C3	P42330	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ATP5G3	P48201	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CD81	P60033	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	NF1	P21359	2839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC17A3	O00476	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TCRA	P04437	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	GNG4	P50150	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TAS2R60	P59551	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	PSG3	Q16557	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SVBP	Q8N300	66 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		K7EQG2	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SNAPIN	O95295	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TFPI2	P48307	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	PARL	Q9H300	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		B4DEV8	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		C9JCJ5	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		M0R036	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SOCS3	O14543	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	APOC3	P02656	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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