RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF492Q9P255 531 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 A6NHS1 94 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 F6UZH7 168 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 RGS13O14921 159 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 GNRH2O43555 120 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 OR7C2O60412 319 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 MPDU1O75352 247 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 CRISP2P16562 243 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 TCL1AP56279 114 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 HAMPP81172 84 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 FHL2Q14192 279 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 ATP6V1FQ16864 119 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 TVP23CQ96ET8 276 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF479Q96JC4 524 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 Q9H3A6 140 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 E5RGE8 158 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 NXPH4O95158 308 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF138P52744 262 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 RAB2AP61019 212 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 NMES1Q9C002 83 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 MBD2Q9UBB5 411 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 NAGKQ9UJ70 344 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 HSPB11Q9Y547 144 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 PAX4O43316 350 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 MPC2O95563 127 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 CRYBA4P53673 196 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 PDE6HQ13956 83 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ATP5SQ99766 215 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 UPK3BQ9BT76 320 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 RNF24Q9Y225 148 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 PRELID1Q9Y255 219 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 DIRC3C9JPN6 131 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 SSNA1O43805 119 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 Q5BKY6 102 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 S100ZQ8WXG8 99 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 PGPA6NDG6 321 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 H3BNG1 76 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 SIVA1O15304 175 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF415Q09FC8 603 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF266Q14584 549 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 LCE3BQ5TA77 95 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ALG5Q9Y673 324 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 K7EQD1 137 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 CDK2AP2O75956 126 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 TYMSP04818 313 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 GYPEP15421 78 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 C18orf15Q96N68 181 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP10-1P60331 282 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 TTC32Q5I0X7 151 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 Q6AWC8 147 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 Q8N1X5 172 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 Q9UF83 564 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 PRO0255Q9UI72 69 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC3-211ENST00000491581 C9JCJ5 164 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC3-211ENST00000491581 NMBP08949 121 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC3-211ENST00000491581 CSN1S1P47710 185 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC3-211ENST00000491581 XGP55808 180 aa6.02□□□□□ -1.45
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