RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 PBOV1Q9GZY1 135 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 GNG3P63215 75 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 MALSU1Q96EH3 234 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 LYSMD1Q96S90 227 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 PHIPQ8WWQ0 1821 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 SPTA1P02549 2419 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 EML6Q6ZMW3 1958 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 RIIAD1A6NNX1 92 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 TCTAP57738 103 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf137Q5JT78 98 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 OR2J1Q9GZK6 312 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 PCTPQ9UKL6 214 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 MYH10P35580 1976 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 IGSF10Q6WRI0 2623 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 MGAMO43451 1857 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 NFYBP25208 207 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 GPER1Q99527 375 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 GID8Q9NWU2 228 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 TRIOO75962 3097 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 ROCK1Q13464 1354 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF831Q5JPB2 1677 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 DHFRP00374 187 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 DYNLT3P51808 116 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R41P59536 307 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 Q8IYB0 196 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 NPCDR1Q9BY65 106 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 COL12A1Q99715 3063 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 EXPH5Q8NEV8 1989 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 IGF2RP11717 2491 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 DSPP15924 2871 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-EP13747 358 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 PLCXD2Q0VAA5 305 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 IFT20Q8IY31 132 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 OR10K1Q8NGX5 313 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 DUOX1Q9NRD9 1551 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA14P01570 189 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 SNCBQ16143 134 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 BOLA2Q9H3K6 86 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 BIN3Q9NQY0 253 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 ITPR1Q14643 2758 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 CHD7Q9P2D1 2997 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 CHD9Q3L8U1 2897 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 NEK7Q8TDX7 302 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 CD163L1Q9NR16 1453 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 FRYLO94915 3013 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 CEP192Q8TEP8 1941 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 LAMA5O15230 3695 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 RGPD2P0DJD1 1756 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 NFAT5O94916 1531 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD11O43934 449 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 OGNP20774 298 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 G0S2P27469 103 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 GNG10P50151 68 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 TRIQKQ629K1 86 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 GRINAQ7Z429 371 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 POPDC3Q9HBV1 291 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 TSC2P49815 1807 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 STX19Q8N4C7 294 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 NUP35Q8NFH5 326 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 POLEQ07864 2286 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 NF1P21359 2839 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa2.42□□□□□ -2.02
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