RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	SIX6	O95475	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	CRISP2	P16562	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	ATP5S	Q99766	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		H0YIZ8	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PAX4	O43316	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	SSNA1	O43805	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	OR7C2	O60412	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	GPX1	P07203	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	HOXA5	P20719	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	CSN1S1	P47710	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TCL1A	P56279	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	H2BFS	P57053	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	ERCC8	Q13216	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		Q6ZTI0	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A096LPF7	62 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		A6NHS1	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		K7EP13	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RGS13	O14921	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	MPC2	O95563	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	OR10J4	P0C629	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF138	P52744	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TAS2R45	P59539	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	IFITM3	Q01628	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	CD300C	Q08708	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	SPINK4	O60575	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	SRI	P30626	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	SLA	Q13239	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	PRR9	Q5T870	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		Q8TAT8	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	VGLL1	Q99990	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	CRYGD	P07320	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF266	Q14584	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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