RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487704.5

RTCB-205, Transcript of RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase, human

TSL 2

Gene RTCB, Length 767 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTCB-205	ENST00000487704	IFNA7	P01567	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	GNAO1	P09471	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	INPP1	P49441	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	SELENOT	P62341	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704		H3BQ15	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704		H3BTX0	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	LINC00869	P0C866	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	CRYGA	P11844	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	COX6A2	Q02221	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	MIA	Q16674	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTCB-205	ENST00000487704	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704		M0R3E3	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	CRP	P02741	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	PRSS3	P35030	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF138	P52744	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	SRPX	P78539	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE1	Q13065	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE4	Q13068	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE5	Q13069	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF266	Q14584	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704		K7EPK0	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	CTDSPL	O15194	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	AKR1C4	P17516	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704		Q6AWC8	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704		Q9UF83	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	GNRH2	O43555	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	TMEM127	O75204	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	HOXB5	P09067	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	VCX	Q9H320	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTCB-205	ENST00000487704	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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