RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3-53P01767 116 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 CSN1S1P47710 185 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 CRYBA4P53673 196 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 NHLH2Q02577 135 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 PRR9Q5T870 116 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 ENKURQ8TC29 256 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 PAXXQ9BUH6 204 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 E5RGE8 158 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 CDPF1Q6NVV7 123 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 NEGR1Q7Z3B1 354 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 RBAKDNA6NC62 111 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 K7EP13 123 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 DEFA1P59665 94 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 DEFA3P59666 94 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 FHL2Q14192 279 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 LYPD5Q6UWN5 251 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 LYPD1Q8N2G4 141 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 FXYD5Q96DB9 178 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 C8orf49Q96NF6 230 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 OR10J4P0C629 311 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 IFITM3Q01628 133 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 PRAF2O60831 178 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF266Q14584 549 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 IQCF2Q8IXL9 164 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 Q8TAT8 98 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 NMES1Q9C002 83 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 OR7C2O60412 319 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 Q6ZQT7 251 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 PHYHIPLQ96FC7 376 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 LENEPQ9Y5L5 61 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-215ENST00000484986 EPM2AB3EWF7 344 aa15.08■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 SRIP30626 198 aa15.08■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 RANP62826 216 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 SPXQ9BT56 116 aa15.08■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 ORM1P02763 201 aa15.07■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 MUC21Q5SSG8 566 aa15.07■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.07■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 OR10G4Q8NGN3 311 aa15.07■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 RASL10AQ92737 203 aa15.07■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.07■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 MDFICQ9P1T7 246 aa15.07■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 TRGV11A0A075B6L2 103 aa15.06■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 K7EQD1 137 aa15.06■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 EVI2AP22794 236 aa15.06■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.06■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 Q6AWC8 147 aa15.06■□□□□ 0
PTPRN-215ENST00000484986 SIX6O95475 246 aa15.05■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 IFNA5P01569 189 aa15.05■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 TAS2R45P59539 299 aa15.05■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 TXNDC17Q9BRA2 123 aa15.05■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa15.05■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM183BQ1AE95 376 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 KHDC3LQ587J8 217 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 TMED6Q8WW62 240 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF479Q96JC4 524 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 ATP5SQ99766 215 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 MSRB1Q9NZV6 116 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 A0A087WTM6 91 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 C9JCJ5 164 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 DIRC3C9JPN6 131 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 H0YIZ8 118 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 SFTA3P0C7M3 94 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 GYPEP15421 78 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 DNAH10OSP0CZ25 163 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 TDRG1Q3Y452 100 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV4A0A0B4J268 109 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 FAM74A1Q5RGS3 127 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 CMTM2Q8TAZ6 248 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 PET100P0DJ07 73 aa15□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 OR4C5Q8NGB2 326 aa15□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 HYLS1Q96M11 299 aa15□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 OTORQ9NRC9 128 aa15□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 NAGKQ9UJ70 344 aa15□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 M0R2P5 195 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 CRYGDP07320 174 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 XGP55808 180 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 FRZBQ92765 325 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 HSPB11Q9Y547 144 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 FAT1Q14517 4588 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 MBD2Q9UBB5 411 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms