RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481383.1

FXR1-215, Transcript of FMR1 autosomal homolog 1, human

TSL 3

Gene FXR1, Length 909 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FXR1-215	ENST00000481383	C20orf202	A1L168	122 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383		H0YJW9	148 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	IFNA1	P01562	189 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	IGKV1-16	P04430	117 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RND2	P52198	227 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	EBI3	Q14213	229 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	BATF	Q16520	125 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RTL8B	Q17RB0	113 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383		Q8N9W7	124 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	TMEM56	Q96MV1	263 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	FBXL15	Q9H469	300 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383		K7EMT4	169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	CNIH1	O95406	144 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	APELA	P0DMC3	54 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	CATR1	Q13166	79 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	PDPN	Q86YL7	162 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	MTURN	Q8N3F0	131 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383		Q8N6K4	173 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR4X1	Q8NH49	305 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RARRES2	Q99969	163 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	C16orf95	Q9H693	158 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383		A6NDN8	102 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR11H12	B2RN74	326 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383		G3V318	75 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383		H7BYZ3	331 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	NDUFA3	O95167	84 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	CA2	P00918	260 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	IGLV2-23	P01705	113 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR5AL1	P0C617	328 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	CD28	P10747	220 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	VDAC1	P21796	283 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	S100G	P29377	79 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	PIGP	P57054	158 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	SELENOT	P62341	195 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	IL15RA	Q13261	267 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	ZNF726P1	Q15940	193 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383		Q8N2B8	174 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR11H1	Q8NG94	326 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR11H2	Q8NH07	326 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR4S2	Q8NH73	311 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	P2RX4	Q99571	388 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	VAMP8	Q9BV40	100 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FXR1-215	ENST00000481383	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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