RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 FOXL1Q12952 345 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 Q6ZQT7 251 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF738Q8NE65 137 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 OR1N2Q8NGR9 330 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 IMMP2LQ96T52 175 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF492Q9P255 531 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 PEMTQ9UBM1 199 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 UFC1Q9Y3C8 167 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1W2PS18 150 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 C2orf70A6NJV1 201 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BKO60814 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 SH2D1AO60880 128 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 P01737 135 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 TYMSP04818 313 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BJP06899 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BOP23527 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BBP33778 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 NDUFA6P56556 154 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BDP58876 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BCP62807 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 NUP35Q8NFH5 326 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 OR11H1Q8NG94 326 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 GTSF1Q8WW33 167 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 DPF1Q92782 380 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 PRR25Q96S07 402 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 NEU1Q99519 415 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 C16orf95Q9H693 158 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 AGRNO00468 2067 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1B0GUS0 222 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 A8MWP6 167 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 LINC01619G3V211 115 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 LGALS9O00182 355 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP10-3P60369 221 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 PRR9Q5T870 116 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 DCANP1Q8TF63 244 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 TSKUQ8WUA8 353 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 SORL1Q92673 2214 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM12Q96EX1 92 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 NRN1Q9NPD7 142 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.59□□□□□ -1.67
SKAP2-204ENST00000481204 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 RBAKDNA6NC62 111 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 C5orf52A6NGY3 159 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 HIGD1CA8MV81 97 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 CSN3P07498 182 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF688P0C7X2 276 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 CT45A10P0DMU9 189 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 MEOX2P50222 304 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF138P52744 262 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 RAB4BP61018 213 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SSTP61278 116 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 MUC21Q5SSG8 566 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF575Q86XF7 245 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms