RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.79□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 Q71RC1 249 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF747Q9BV97 191 aa4.79□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 PTPN13Q12923 2485 aa4.79□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 M0QZ24 198 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 S100A8P05109 93 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 CACNG7P62955 275 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 RNF182Q8N6D2 247 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 H3BTX0 84 aa4.78□□□□□ -1.64
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PRKCI-202ENST00000476635 PRR9Q5T870 116 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 CENPEQ02224 2701 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 C9orf85Q96MD7 179 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 ZANQ9Y493 2812 aa4.78□□□□□ -1.64
PRKCI-202ENST00000476635 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 HIGD1CA8MV81 97 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 PAFAH1B2P68402 229 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 HBBP68871 147 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 OR4C46A6NHA9 309 aa4.77□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.77□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 H3BMM0 161 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 ERCC8Q13216 396 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF738Q8NE65 137 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.77□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM189A5PLL7 270 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TRGC2P03986 189 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TRGC1P0CF51 173 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TSPOP30536 169 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 RIGQ13278 110 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 DPF1Q92782 380 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 ITPR2Q14571 2701 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1B0GUT8 65 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 C7orf71A4D174 169 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 A8MZ25 164 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 LINC00310P59036 64 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 KCNS1Q96KK3 526 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 ABCA1O95477 2261 aa4.76□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 DUX5Q96PT3 197 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IFITM10A6NMD0 228 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 M0R381 172 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 CDKN1BP46527 198 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 DEFB136Q30KP8 78 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 Q8TAT8 98 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 RNF185Q96GF1 192 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.75□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 C18orf15Q96N68 181 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 PPBPP02775 128 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 KIR3DS1Q14943 382 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.74□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 K7EMI3 77 aa4.73□□□□□ -1.65
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