RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, human

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PREB-208	ENST00000468045	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	ATP5L	O75964	103 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	PDE6H	Q13956	83 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	GLMP	Q8WWB7	406 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	PTH2	Q96A98	100 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	APOM	O95445	188 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	LINC01546	A6NGU7	62 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	THBD	P07204	575 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045		Q8N8P6	123 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	MT-ATP8	P03928	68 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	SPINK8	P0C7L1	97 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	FHL3	Q13643	280 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	BSN	Q9UPA5	3926 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	HES1	Q14469	280 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	ABCA4	P78363	2273 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045		A0A087WX48	190 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	LAGE3	Q14657	143 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	MFAP4	P55083	255 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	CDIP1	Q9H305	208 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	NDP	Q00604	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	NRAC	Q8N912	160 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	TGFA	P01135	160 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	FOXI1	Q12951	378 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	PSMB2	P49721	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	KLRD1	Q13241	179 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	LINC01549	A6NIU2	74 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045		B5MCH6	92 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	NBR2	O15453	112 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045		J3KRW8	73 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045		Q9UFV3	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	TAL2	Q16559	108 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	OR11H2	Q8NH07	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	CTSG	P08311	255 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045		E7EQL1	145 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	XG	P55808	180 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	LY6H	O94772	140 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	ACACA	Q13085	2346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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