RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462130.1

HDLBP-230, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-230ENST00000462130 PRM2P04554 102 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 HTN3P15516 51 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 VGLL1Q99990 258 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 DKK2Q9UBU2 259 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 A0A1B0GV50 99 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 A8MTW9 85 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 HBE1P02100 147 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 CSN1S1P47710 185 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 SUN5Q8TC36 379 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00477Q96M19 166 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 OTORQ9NRC9 128 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 DIRC3C9JPN6 131 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 UBE2G2P60604 165 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 GNG5P63218 68 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 RRN3P1Q2M238 152 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 RNF212Q495C1 297 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 SLC51BQ86UW2 128 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 STOML3Q8TAV4 291 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 SGK494Q96LW2 274 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 LINC01587Q99440 93 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 UMAD1C9J7I0 102 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 HTN1P15515 57 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 CDKN1BP46527 198 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 DAD1P61803 113 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 CCL20P78556 96 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-230ENST00000462130 RYR1P21817 5038 aa7.15□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 AZU1P20160 251 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 TSPOP30536 169 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF138P52744 262 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 Q6ZR54 194 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 ATG101Q9BSB4 218 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF492Q9P255 531 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 EPDR1Q9UM22 224 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 A0A1W2PRE2 83 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 PAGE4O60829 102 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 INSP01308 110 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 IFNA7P01567 189 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 GPX1P07203 203 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 LEPP41159 167 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 SULT1A2P50226 295 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 CST9LP1Q5W188 147 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 Q6ZQT7 251 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF575Q86XF7 245 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 Q8TAT8 98 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00479Q96M42 142 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 RBAKDNA6NC62 111 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 FAM74A7A6NL05 159 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 GGTLC3B5MD39 225 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 TCRAP04437 139 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 RAB5CP51148 216 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 TVP23CQ96ET8 276 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 BTN1A1Q13410 526 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-230ENST00000462130 PRR9Q5T870 116 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms