RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 S100A1P23297 94 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 GLYATL3Q5SZD4 288 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 CASC2Q6XLA1 102 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM91Q6ZNR0 172 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 TSC22D3Q99576 134 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 COPZ2Q9P299 210 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFP30Q9Y2G7 519 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 BICRAQ9NZM4 1560 aa1.84□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR7Q9Y4E6 1490 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BRM9 83 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV3-33P01772 117 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZSA8 131 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ZGRF1Q86YA3 2104 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 MPC1Q9Y5U8 109 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 SYNJ1O43426 1573 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 MYH6P13533 1939 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 OVOS2Q6IE36 1432 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 DLG5Q8TDM6 1919 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 CD14P08571 375 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 HLA-DRB4P13762 266 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 EVI2AP22794 236 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 AKR1D1P51857 326 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 LSM3P62310 102 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 OTOSQ8NHW6 89 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM3Q9BZL3 60 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 FGD6Q6ZV73 1430 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ERBINQ96RT1 1412 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 TET1Q8NFU7 2136 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A096LPI6 279 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 A6NN06 94 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFA2O43678 99 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM24O75264 130 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ANGP03950 147 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 CD3DP04234 171 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 GDF5OSQ5U4N7 250 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 C10orf105Q8TEF2 133 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 SCRIBQ14160 1630 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAL4O96015 105 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 TSPAN19P0C672 248 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 COX4I1P13073 169 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ETV6P41212 452 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 IZUMO2Q6UXV1 221 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 COL6A6A6NMZ7 2263 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 IGLC6P0CF74 106 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 PCBD1P61457 104 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ARL17AQ8IVW1 177 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00526Q96FQ7 95 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 PFDN5Q99471 154 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 TPT1P8Q9HAU6 139 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM14CQ9P0S9 112 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 COMMD3Q9UBI1 195 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 SOGA1O94964 1423 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 IFITM5A6NNB3 132 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 EDF1O60869 148 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 LYNX1P0DP58 116 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 IL9P15248 144 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 CKS2P33552 79 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 NEDD8Q15843 81 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 CCSMST1Q4G0I0 132 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-205ENST00000462042 E9PCH4 1651 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 DISP2A7MBM2 1401 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 SULT1C4O75897 302 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 PPYP01298 95 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 APOC1P02654 83 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00694P0DN24 101 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 C10orf111Q8N326 155 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 TSTD1Q8NFU3 115 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 TNFSF18Q9UNG2 199 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 SPEF2Q9C093 1822 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R2Z0 102 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 KDELR1P24390 212 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJB13P59910 316 aa1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms