RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 DAD1P61803 113 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF266Q14584 549 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 KHDC3LQ587J8 217 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB24Q969Q5 203 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 SGK494Q96LW2 274 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 GPX1P07203 203 aa4.91□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZTI0 123 aa4.91□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZNX1 250 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGEF1-206ENST00000461017 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6AWC8 147 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.88□□□□□ -1.63
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