RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457264.5

MRPL55-222, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 3

Gene MRPL55, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-222	ENST00000457264	GYPE	P15421	78 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	ZNF138	P52744	262 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	CRYGD	P07320	174 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	S100A10	P60903	97 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	ATP6V1F	Q16864	119 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	C2orf50	Q96LR7	162 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	FAT1	Q14517	4588 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	PSCA	O43653	123 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	ZNF479	Q96JC4	524 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL55-222	ENST00000457264	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264		Q6ZSN1	163 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264		Q8TAT8	98 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	RASL10A	Q92737	203 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	SPX	Q9BT56	116 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264		C9JCJ5	164 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	IL7	P13232	177 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	CSN1S1	P47710	185 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	HAMP	P81172	84 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264		J3QL48	77 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	ZNF266	Q14584	549 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	MYCBP2	O75592	4640 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TCRB	P04435	133 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	OR10J4	P0C629	311 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	RAB32	Q13637	225 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	RBAKDN	A6NC62	111 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	PLA2G10	O15496	165 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	LYRM1	O43325	122 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	PPT1	P50897	306 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	IL15RA	Q13261	267 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264		Q6AWC8	147 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	NUDT15	Q9NV35	164 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	NAGK	Q9UJ70	344 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	OR7C2	O60412	319 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TIRAP	P58753	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	NHLH2	Q02577	135 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL55-222	ENST00000457264	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264		M0R2P5	195 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264		Q8N814	137 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	TDRG1	Q3Y452	100 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264		Q9HAA7	133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	DIRC3	C9JPN6	131 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	GNRH2	O43555	120 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MRPL55-222	ENST00000457264	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		11.17	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms