RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BMI1P35226 326 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HBG1P69891 147 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HBG2P69892 147 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMG4Q5JS54 123 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCANP1Q8TF63 244 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GGACTQ9BVM4 153 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPB11Q9Y547 144 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGRNO00468 2067 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FNDC10F2Z333 226 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BRN7 92 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX7A2P2O60397 106 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PET100P0DJ07 73 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAFAH1B2P68402 229 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF546Q86UE3 836 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00052Q96N35 136 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSG1Q9BU20 258 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARV1Q9H2C2 271 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 G3V3Q6 166 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HLA-DMBP28068 263 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B2MP61769 119 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SELENOTP62341 195 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP5SQ99766 215 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSMD3Q7Z407 3707 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F6UB75 175 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV3-20P01619 116 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB31Q13636 194 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP6V1FQ16864 119 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C10orf113Q5VZT2 155 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF182Q8N6D2 247 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 U3KQK5 164 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD5P06127 495 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALR1P47211 349 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FXYD7P58549 80 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB135Q30KP9 77 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf194Q5T5A4 169 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BQ15 152 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC17A3O00476 420 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARPC5O15511 151 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFNA5P01569 189 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PYYP10082 97 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF709Q8N972 641 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AQP10Q96PS8 301 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GVG6 124 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPDU1O75352 247 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSPAN13O95857 204 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB2AP61019 212 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM78BQ5VT40 261 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0J9YWU9 116 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BMM0 161 aa5.96□□□□□ -1.46
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