RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GUS0 222 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZWC4 215 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 GTSF1Q8WW33 167 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 C14orf144Q96I85 54 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0G2JLM5 398 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 J3QLI3 93 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0R143 59 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFA4O00483 81 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-23P01764 117 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRGV3P03979 118 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGF1P05019 195 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLEC3BP05452 202 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00310P59036 64 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEX29Q8N6K0 151 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 RCHY1Q96PM5 261 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 DUX5Q96PT3 197 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR25Q96S07 402 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASCL2Q99929 193 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 F2Z2F3 143 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0R3E3 92 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 BUB3O43684 328 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 SH2D1AO60880 128 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 FSHBP01225 129 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL3P36405 182 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTRLP40313 264 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 FA2HQ7L5A8 372 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC140Q96MF4 163 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPPP3Q9BW30 176 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF580Q9UK33 172 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUPR1O60356 82 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 LEPROTL1O95214 131 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHG2P01859 326 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPBPP02775 128 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA45Q537H7 98 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCN12Q6JVE5 192 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 ORMDL3Q8N138 153 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 AJUBAQ96IF1 538 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 C17orf77Q96MU5 243 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 G3V318 75 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 H3BUX3 64 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00614P0C842 121 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 C3orf79P0CE67 100 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF138P52744 262 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 SSTP61278 116 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 NIT1Q86X76 327 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM219Q86XT9 240 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 C16orf92Q96LL3 132 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 C8orf49Q96NF6 230 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 A6NDX4 124 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0QZ24 198 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 OVOL1O14753 267 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 ORM1P02763 201 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PF4P02776 101 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PF4V1P10720 104 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 CACNG7P62955 275 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.83□□□□□ -1.64
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