RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A096LPF7 62 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRSS47A8MTI9 375 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPINK4O60575 86 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRR9Q5T870 116 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 THAP6Q8TBB0 222 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BLNKQ8WV28 456 aa6.48□□□□□ -1.37
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FUT9Q9Y231 359 aa6.48□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.47□□□□□ -1.37
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 NHLH2Q02577 135 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ICAM4Q14773 271 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FXYD5Q96DB9 178 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VGLL1Q99990 258 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF492Q9P255 531 aa6.47□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.47□□□□□ -1.37
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 E5RGE8 158 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H0YIZ8 118 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SIX6O95475 246 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP10-2P60368 255 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q6ZQT7 251 aa6.46□□□□□ -1.38
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NMES1Q9C002 83 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR51M1Q9H341 326 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.46□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.46□□□□□ -1.38
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF138P52744 262 aa6.45□□□□□ -1.38
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.45□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q8TAT8 98 aa6.45□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ENKURQ8TC29 256 aa6.45□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 S100ZQ8WXG8 99 aa6.45□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PAXXQ9BUH6 204 aa6.45□□□□□ -1.38
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRAF2O60831 178 aa6.44□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UPK1BO75841 260 aa6.44□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H2BFSP57053 126 aa6.44□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF266Q14584 549 aa6.44□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.44□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.44□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRO0255Q9UI72 69 aa6.44□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.44□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SIVA1O15304 175 aa6.43□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR7C2O60412 319 aa6.43□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NXPH4O95158 308 aa6.43□□□□□ -1.38
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.43□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP5SQ99766 215 aa6.43□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.43□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HERC1Q15751 4861 aa6.43□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CSN1S1P47710 185 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RANP62826 216 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q6AWC8 147 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C8orf49Q96NF6 230 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MDFICQ9P1T7 246 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HSPB11Q9Y547 144 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAT1Q14517 4588 aa6.42□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C9orf118A6NHY6 69 aa6.41□□□□□ -1.38
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DIRC3C9JPN6 131 aa6.41□□□□□ -1.38
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