RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 EFNA4P52798 201 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 Q8N8P6 123 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 SIGMAR1Q99720 223 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 ATP5LO75964 103 aa10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 C12orf74Q32Q52 190 aa10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 NPBQ8NG41 125 aa10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 GAGE12HA6NDE8 117 aa10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 SMPXQ9UHP9 88 aa10.24□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 LINC01559Q495D7 138 aa10.23□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 HIST1H4GQ99525 98 aa10.23□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 PSMG4Q5JS54 123 aa10.23□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 F8W1H4 67 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 INSL3P51460 131 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 B9A039 149 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 LAGE3Q14657 143 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 NRACQ8N912 160 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 KLK15Q9H2R5 256 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 NBASA2RRP1 2371 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED8-201ENST00000408953 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 A0A087WX48 190 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 SPRY2O43597 315 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 LINC01560Q8TB33 94 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 CD3EP07766 207 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 LY6G5BQ8NDX9 201 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 SPTA1P02549 2419 aa10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 ATP5G2Q06055 141 aa10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 GAGE13Q4V321 117 aa10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 CLEC3BP05452 202 aa10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10.19□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 BUB3O43684 328 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 HLA-DRB4P13762 266 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 RRN3P1Q2M238 152 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 C15orf32Q32M92 178 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF292O60281 2723 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 J3QR89 54 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 PRO0461Q9UI25 63 aa10.18□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 TAL2Q16559 108 aa10.17□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.17□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 J3KRW8 73 aa10.17□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 PLNP26678 52 aa10.17□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 SFTA2Q6UW10 78 aa10.17□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 Q8NA96 180 aa10.17□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 ODF3BA8MYP8 253 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 H3BVH4 76 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 ECSCRQ19T08 205 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 SPATA25Q9BR10 227 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 A0A1B0GWB2 263 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 OR11H12B2RN74 326 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 F8VRH5 84 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 H7C1H1 209 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 SCGB2A1O75556 95 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 SCGB1A1P11684 91 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 OR11H1Q8NG94 326 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 OR11H2Q8NH07 326 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.15□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 C20orf78Q9BR46 151 aa10.15□□□□□ -0.78
ZBED8-201ENST00000408953 RBAKDNA6NC62 111 aa10.15□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PRSS47A8MTI9 375 aa10.15□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 IGF1P05019 195 aa10.15□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PRTN3P24158 256 aa10.15□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 CLEC19AQ6UXS0 136 aa10.15□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms