RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP4-202ENST00000392011 MYO9AB2RTY4 2548 aa13.62□□□□□ -0.23
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SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf16Q68DN1 1984 aa13.56□□□□□ -0.24
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SH3BP4-202ENST00000392011 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.56□□□□□ -0.24
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SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa13.56□□□□□ -0.24
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SH3BP4-202ENST00000392011 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 MSMPQ1L6U9 139 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.55□□□□□ -0.24
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SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV1-17P01599 117 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.55□□□□□ -0.24
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SH3BP4-202ENST00000392011 SIGMAR1Q99720 223 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 CST9LQ9H4G1 147 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 SPRY2O43597 315 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP4-202ENST00000392011 J3QLI3 93 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 COX11Q9Y6N1 276 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 K7EIM0 57 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 PATE2Q6UY27 113 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM2Q9BVW6 85 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE7O76087 117 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE12FP0CL80 117 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE12GP0CL81 117 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE12IP0CL82 117 aa13.52□□□□□ -0.24
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