RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 NDFIP1Q9BT67 221 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0D9SG52 128 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PRE2 83 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 ARPC5O15511 151 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TCL1AP56279 114 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 SLAQ13239 276 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 BTN1A1Q13410 526 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNS1Q96KK3 526 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 SPXQ9BT56 116 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.99□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE12BA1L429 117 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 SPINK4O60575 86 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE7O76087 117 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE12FP0CL80 117 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE12GP0CL81 117 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE12IP0CL82 117 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 CCL18P55774 89 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF415Q09FC8 603 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5I1Q13606 314 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TDRG1Q3Y452 100 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 STOML3Q8TAV4 291 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 ATG101Q9BSB4 218 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TREM1Q9NP99 234 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.98□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 UMAD1C9J7I0 102 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 F6UZH7 168 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 G3V3Q6 166 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TCRAP04437 139 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 PPT1P50897 306 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZTI0 123 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8TAT8 98 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 EPDR1Q9UM22 224 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.97□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 NUDT3O95989 172 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SEC11BP0C7V7 166 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 FHITP49789 147 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFP69Q49AA0 526 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR9Q5T870 116 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 KMT2AQ03164 3969 aa5.96□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 IFNA7P01567 189 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SMUG1Q53HV7 270 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 RASL10AQ92737 203 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PSG8Q9UQ74 426 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 NACAE9PAV3 2078 aa5.95□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 GGTLC3B5MD39 225 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 M0R2P5 195 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 BCL2L11O43521 198 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 CIDEAO60543 219 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PFDN1O60925 122 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 HOXA5P20719 270 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 GNG5P63218 68 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF726P1Q15940 193 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 MUC21Q5SSG8 566 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZR54 194 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TVP23CQ96ET8 276 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PRO0255Q9UI72 69 aa5.94□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM74A7A6NL05 159 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SMLR1H3BR10 107 aa5.93□□□□□ -1.46
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