RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 LYNX1P0DP58 116 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 RHODO00212 210 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf52Q96A22 123 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 E9PQ18 207 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 KLRD1Q13241 179 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFS7O75251 213 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 HAMPP81172 84 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 J3QQQ9 107 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01545Q5VT33 79 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 PTPRBP23467 1997 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 K7EN84 100 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 CRYBA4P53673 196 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 LMO1P25800 156 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 NPYP01303 97 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 K7EMI3 77 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 E9PLN8 166 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 POU2AF1Q16633 256 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 LTAP01374 205 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 FXYD5Q96DB9 178 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 PRR25Q96S07 402 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 DKK1O94907 266 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 DKK2Q9UBU2 259 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SAP30O75446 220 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-53P01767 116 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 VWC2Q2TAL6 325 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 C20orf78Q9BR46 151 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 H3BRN7 92 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 IGHG3P01860 377 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 ACYP1P07311 99 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZVH6 145 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF747Q9BV97 191 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 CRLF1O75462 422 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 PFN2P35080 140 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SHISA9B4DS77 424 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 PCP2Q8IVA1 136 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 H3BUX3 64 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 EFNA4P52798 201 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 HERVK_113P63121 156 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1-39P01597 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1D-39P04432 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 J3KT08 172 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 CSRP2Q16527 193 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 GATA4P43694 442 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SYNJ2BPP57105 145 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.02□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.02□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.02□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 CFC1BP0CG36 223 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 CFC1P0CG37 223 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 WIPF3A6NGB9 483 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 DSCR9P59020 149 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 VOPP1Q96AW1 172 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 THAP8Q8NA92 274 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 Q0VFX4 171 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFC2O95298 119 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 ATP6V0E1O15342 81 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-204ENST00000373190 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.01□□□□□ -1.29
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