RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 K7EIM0 57 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 NDUFA3O95167 84 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 IGHV3-48P01763 117 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 TDHQ8IZJ6 230 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 NRACQ8N912 160 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 TIMD4Q96H15 378 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 CARD19Q96LW7 228 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 KNL1Q8NG31 2342 aa5.78□□□□□ -1.48
GABPB2-201ENST00000368916 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 SMKR1H3BMG3 65 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 C16orf97H3BN30 126 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 H3BTX0 84 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 M0R1B8 84 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 COX6B1P14854 86 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 ERCC8Q13216 396 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 UTF1Q5T230 341 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 SDK2Q58EX2 2172 aa5.77□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 PI4KAP42356 2102 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 C11orf86A6NJI1 115 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 C17orf100A8MU93 164 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 H3BT86 120 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 M0R3E3 92 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 CNIH1O95406 144 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 COX6CP09669 75 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 DLX6P56179 175 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 MDFICQ9P1T7 246 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 U3KQE9 123 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 BRCA2P51587 3418 aa5.76□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 A0A0J9YX75 114 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 A0A0J9YY99 117 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM178BH3BS89 294 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TCL1BO95988 128 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 IGLV1-47P01700 117 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 FXYD7P58549 80 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 HES3Q5TGS1 186 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 NPBQ8NG41 125 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 C17orf77Q96MU5 243 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 ONECUT1Q9UBC0 465 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 MYO9BQ13459 2157 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 H3BVH4 76 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 IGHV3-30P01768 117 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 CFC1BP0CG36 223 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 CFC1P0CG37 223 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 CCL3L1P16619 93 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 AJUBAQ96IF1 538 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TIMM17AQ99595 171 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.75□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 CACNA1EQ15878 2313 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 OOSP1A8MZH6 123 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 HERV-K104P63124 156 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 PMVKQ15126 192 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 KLK9Q2XQG4 91 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 BAALCQ8WXS3 180 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.74□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 M0R2P5 195 aa5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 NBR2O15453 112 aa5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 PRTN3P24158 256 aa5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 MSMPQ1L6U9 139 aa5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.73□□□□□ -1.49
GABPB2-201ENST00000368916 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms