RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 H3BMM0 161 aa21.8■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa21.8■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 C15orf54Q8N8G6 183 aa21.8■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 NHLRC2Q8NBF2 726 aa21.8■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 ERVFC1-1P60608 527 aa21.8■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 OR10J6PQ8NGY7 276 aa21.8■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 VGLL1Q99990 258 aa21.8■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV3-20P01619 116 aa21.79■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 OR4B1Q8NGF8 309 aa21.79■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF492Q9P255 531 aa21.79■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 IMMP2LQ96T52 175 aa21.78■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 A8MZ25 164 aa21.77■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 DEFA6Q01524 100 aa21.77■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB121Q5J5C9 76 aa21.77■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 YPEL4Q96NS1 127 aa21.77■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 ERCC8Q13216 396 aa21.76■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM78Q5T7P6 136 aa21.76■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 NDFIP1Q9BT67 221 aa21.76■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 LENEPQ9Y5L5 61 aa21.76■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPB6E9PJ23 425 aa21.75■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00477Q96M19 166 aa21.75■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa21.75■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 V9GYV3 84 aa21.75■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF138P52744 262 aa21.74■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa21.74■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 C19orf71A6NCJ1 209 aa21.73■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 COLCA2A8K830 154 aa21.73■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa21.73■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 MRAPQ8TCY5 172 aa21.73■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa21.73■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 A8MTW9 85 aa21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 PFN1P07737 140 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 S100PP25815 95 aa21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 ELOBQ15370 118 aa21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 PRR27Q6MZM9 219 aa21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 NUDT10Q8NFP7 164 aa21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 NUDT11Q96G61 164 aa21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 CLUHP3Q96NS8 147 aa21.72■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 CT45A10P0DMU9 189 aa21.71■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 Q8TAT8 98 aa21.71■■□□□ 1.07
ECHS1-201ENST00000368547 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa21.7■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 KCNIP4Q6PIL6 250 aa21.7■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 AMTNQ6UX39 209 aa21.7■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 IL36BQ9NZH7 164 aa21.7■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf49Q96NF6 230 aa21.69■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 GATCO43716 136 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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ECHS1-201ENST00000368547 CT83Q5H943 113 aa21.69■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa21.69■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa21.67■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 P01737 135 aa21.67■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 FXYD7P58549 80 aa21.67■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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ECHS1-201ENST00000368547 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 BTF3L4Q96K17 158 aa21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 ASCL2Q99929 193 aa21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 PYGO2Q9BRQ0 406 aa21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 CSTL1Q9H114 145 aa21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 CRIP1P50238 77 aa21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 FAM162BQ5T6X4 162 aa21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa21.65■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa21.65■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 M0R2Z0 102 aa21.65■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 SPINK13Q1W4C9 94 aa21.65■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DL5AQ8N109 375 aa21.65■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa21.65■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 FAM19A4Q96LR4 140 aa21.65■■□□□ 1.06
ECHS1-201ENST00000368547 ODF3Q96PU9 254 aa21.64■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 CA1P00915 261 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 TSKUQ8WUA8 353 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 XCL2Q9UBD3 114 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 A8MWL6 223 aa21.61■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 CXCL1P09341 107 aa21.61■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 CRISP2P16562 243 aa21.61■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 CDKN1BP46527 198 aa21.61■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 FAM231BA6NCW3 169 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 FABP5P3A8MUU1 101 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 J3KRW8 73 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 SH2D1AO60880 128 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 RAB5AP20339 215 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 TSPOP30536 169 aa21.6■■□□□ 1.05
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