RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHB2Q96CS7 222 aa16.81■□□□□ 0.28
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OPN3-201ENST00000366554 ZNF815PA8K554 130 aa16.81■□□□□ 0.28
OPN3-201ENST00000366554 COX6B1P14854 86 aa16.81■□□□□ 0.28
OPN3-201ENST00000366554 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
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OPN3-201ENST00000366554 ERCC8Q13216 396 aa16.74■□□□□ 0.27
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OPN3-201ENST00000366554 C10orf126Q8N4M7 172 aa16.73■□□□□ 0.27
OPN3-201ENST00000366554 TMEM178BH3BS89 294 aa16.73■□□□□ 0.27
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OPN3-201ENST00000366554 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.72■□□□□ 0.27
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OPN3-201ENST00000366554 C22orf34Q6ZV56 151 aa16.72■□□□□ 0.27
OPN3-201ENST00000366554 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa16.71■□□□□ 0.27
OPN3-201ENST00000366554 PRTN3P24158 256 aa16.71■□□□□ 0.27
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OPN3-201ENST00000366554 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.7■□□□□ 0.26
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OPN3-201ENST00000366554 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.7■□□□□ 0.26
OPN3-201ENST00000366554 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
OPN3-201ENST00000366554 TTC32Q5I0X7 151 aa16.7■□□□□ 0.26
OPN3-201ENST00000366554 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
OPN3-201ENST00000366554 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
OPN3-201ENST00000366554 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
OPN3-201ENST00000366554 CD59P13987 128 aa16.69■□□□□ 0.26
OPN3-201ENST00000366554 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
OPN3-201ENST00000366554 IGHV3-30P01768 117 aa16.69■□□□□ 0.26
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