RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CDKN1BP46527 198 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 SUN5Q8TC36 379 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 TMED6Q8WW62 240 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 Q9H3A6 140 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 PRAC2D3DTV9 90 aa5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 F6UZH7 168 aa5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 H7BYZ3 331 aa5.45□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.45□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 FHITP49789 147 aa5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF138P52744 262 aa5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 DAD1P61803 113 aa5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.45□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF503Q96F45 646 aa5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.45□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 PGPA6NDG6 321 aa5.44□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 P0DMU3 169 aa5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 FAM231AP0DMU4 169 aa5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 FAM231CP0DMU5 169 aa5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 FAM210BQ96KR6 192 aa5.44□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 NACAE9PAV3 2078 aa5.44□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.43□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.43□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.43□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.43□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 J3KRW8 73 aa5.42□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 DEFB130AP0DP74 79 aa5.42□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 BLOC1S1P78537 153 aa5.42□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF726P1Q15940 193 aa5.42□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.42□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.42□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.42□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.42□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.42□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF492Q9P255 531 aa5.42□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 EPDR1Q9UM22 224 aa5.42□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 GGTLC3B5MD39 225 aa5.41□□□□□ -1.54
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SGMS1-201ENST00000361543 SSX7Q7RTT5 188 aa5.41□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.41□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.41□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.41□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 HERC2O95714 4834 aa5.41□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 PEX7O00628 323 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.54
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