RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7EM74 188 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRY3O43610 288 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERVK-16P61578 105 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q5XG85 94 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 S1PR3Q99500 378 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD3EP07766 207 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYCNOSP40205 109 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIRAPP58753 221 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCL11P51671 97 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT83Q5H943 113 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 AMN1Q8IY45 258 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 MDS2Q8NDY4 140 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 DSCR8Q96T75 97 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPTBN2O15020 2390 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLAUP00749 431 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TWIST1Q15672 202 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 MLST8Q9BVC4 326 aa8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFA3O95167 84 aa8.46□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PAX8Q06710 450 aa8.46□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 RIGQ13278 110 aa8.46□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.46□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.46□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF492Q9P255 531 aa8.46□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMG4Q5JS54 123 aa8.46□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR31Q8NA23 367 aa8.46□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 DPH3Q96FX2 82 aa8.46□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 PAXXQ9BUH6 204 aa8.46□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 JPT2Q9H910 190 aa8.46□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.46□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 DSCAMO60469 2012 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 hADV29S1A0JD25 119 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 PGPA6NDG6 321 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 APELAP0DMC3 54 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 LEPP41159 167 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 SHISA9B4DS77 424 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHG3P01860 377 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV1-16P04430 117 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2D1P51668 147 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 ORMDL3Q8N138 153 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.45□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BTX0 84 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 OVOL1O14753 267 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRO0628Q9UI54 55 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 OVOL3O00110 214 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 MALP21145 153 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOXL3P58215 753 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0R1B8 84 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZT83 130 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 C15orf61A6NNL5 157 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 LGALS9O00182 355 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCL13Q99616 98 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 V9GYY9 64 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 H7C2G1 150 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRYGDP07320 174 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 CKS2P33552 79 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF415Q09FC8 603 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms