RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 SAP25Q8TEE9 199 aa8.61□□□□□ -1.03
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SH3BP2-201ENST00000356331 LINC01620Q4KN68 170 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 H0YJW9 148 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 CELA3BP08861 270 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 IGLC1P0CG04 106 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 C22orf46C9J442 243 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 J3QQQ9 107 aa8.61□□□□□ -1.03
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SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV1D-12P01611 117 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.61□□□□□ -1.03
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SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV1-2P23083 117 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 CD24P25063 80 aa8.57□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.56□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.56□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 LINC01560Q8TB33 94 aa8.56□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 CFHR4Q92496 578 aa8.56□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 Q8TAT8 98 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 LINC00311Q8N616 119 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.55□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 LINC00643Q86TS7 51 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 THBDP07204 575 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 C20orf173Q96LM9 149 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-201ENST00000356331 E9PLN8 166 aa8.54□□□□□ -1.04
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SH3BP2-201ENST00000356331 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.54□□□□□ -1.04
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