RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 FOXI1Q12951 378 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 C9JQL5 133 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 FXYD7P58549 80 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CCL3L1P16619 93 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 THAP8Q8NA92 274 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGLL5B9A064 214 aa6.65□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.65□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGLC1P0CG04 106 aa6.65□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 UQCRQO14949 82 aa6.65□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 PSMB8P28062 276 aa6.65□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.65□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.65□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV3-19P01714 112 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00473A8K010 186 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1D-12P01611 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-11P01762 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 CXCL5P42830 114 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 NOTCH4Q99466 2003 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 CTSBP07858 339 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 RNF152Q8N8N0 203 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF747Q9BV97 191 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 Q6P435 159 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 CYYR1Q96J86 154 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 A0A087WWL8 130 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.64□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF134P52741 427 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 AMTNQ6UX39 209 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 A0A087WV48 116 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFC1O43677 76 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 SVIPQ8NHG7 77 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 THBDP07204 575 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 RMI2Q96E14 147 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 PRR25Q96S07 402 aa6.63□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 BRK1Q8WUW1 75 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM213A2RRL7 107 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 LINC01620Q4KN68 170 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZUT4 128 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 HTN3P15516 51 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 PIFOQ8TCI5 191 aa6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 GATA4P43694 442 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00643Q86TS7 51 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 VWC2Q2TAL6 325 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 LYRM9A8MSI8 78 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM178BH3BS89 294 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 C8orf49Q96NF6 230 aa6.61□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 H3BRN7 92 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-46P01743 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 PAX9P55771 341 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 UBE2BP63146 152 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 CFHR1Q03591 330 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 CRYGBP07316 175 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 K7EM74 188 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00479Q96M42 142 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 PRR19A6NJB7 356 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 PSPNO60542 156 aa6.6□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 FXYD5Q96DB9 178 aa6.6□□□□□ -1.35
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