RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 OR10J4P0C629 311 aa14.62□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF266Q14584 549 aa14.62□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.62□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.62□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.62□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.61□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.61□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF492Q9P255 531 aa14.61□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.6□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 SMLR1H3BR10 107 aa14.6□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.6□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 C18orf15Q96N68 181 aa14.6□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 Q9H3A6 140 aa14.6□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 OR7C2O60412 319 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 ATP6V0CP27449 155 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 TCL1AP56279 114 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 ESRGQ1W209 222 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 PRR9Q5T870 116 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 Q6ZNX1 250 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 UPK3BQ9BT76 320 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.59□□□□□ -0.07
SOCS1-201ENST00000332029 RGS13O14921 159 aa14.58□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 CSN1S1P47710 185 aa14.58□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF138P52744 262 aa14.58□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 RAB2AP61019 212 aa14.58□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 RANP62826 216 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.58□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 ARPC5O15511 151 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 SPINK4O60575 86 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 Q6ZQT7 251 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 Q8N1X5 172 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 Q8TAT8 98 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.57□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PPQ1 181 aa14.56□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 SERF2P84101 59 aa14.56□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 A0A096LPF7 62 aa14.55□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 HMSDA8MTL9 139 aa14.55□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 KHDC3LQ587J8 217 aa14.55□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.55□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.55□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 RBAKDNA6NC62 111 aa14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 TAAR5O14804 337 aa14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 TAS2R45P59539 299 aa14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 KRTAP10-2P60368 255 aa14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF345Q14585 488 aa14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.54□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.53□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.53□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SOCS1-201ENST00000332029 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.52□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.52□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PPV4 95 aa14.51□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 DIRC3C9JPN6 131 aa14.51□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 IGHV3-53P01767 116 aa14.51□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 STAG3L2P0CL84 134 aa14.51□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 STAG3L3P0CL85 134 aa14.51□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF415Q09FC8 603 aa14.51□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 SUN5Q8TC36 379 aa14.51□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 PAX4O43316 350 aa14.5□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 MBP02144 154 aa14.5□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 MUC21Q5SSG8 566 aa14.5□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 RAB24Q969Q5 203 aa14.5□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 HYLS1Q96M11 299 aa14.5□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.5□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 Q6AWC8 147 aa14.49□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 OTORQ9NRC9 128 aa14.49□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 PRO0255Q9UI72 69 aa14.49□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.49□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 PGPA6NDG6 321 aa14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 LINC00315P59091 139 aa14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 SLAQ13239 276 aa14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF726P1Q15940 193 aa14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 MDFICQ9P1T7 246 aa14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.48□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 CRYBA4P53673 196 aa14.47□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 FHL2Q14192 279 aa14.47□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.47□□□□□ -0.09
SOCS1-201ENST00000332029 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms