RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 SAMD5Q5TGI4 173 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 NDFIP1Q9BT67 221 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 SHISA2Q6UWI4 295 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 RPL7P18124 248 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 SEC11AP67812 179 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 LY6EQ16553 131 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 CUBNO60494 3623 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 GATA3P23771 443 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 PRTN3P24158 256 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 B5MCH6 92 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 SONP18583 2426 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 PRAC2D3DTV9 90 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF562Q6V9R5 426 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 FXYD2P54710 66 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 RPS20P60866 119 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 CFHR4Q92496 578 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM14CQ9P0S9 112 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 GAS8-AS1O95177 125 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 DEFB1P60022 68 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 HERV-K104P63124 156 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 IFI27L1Q96BM0 104 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 BPESC1Q9GZL8 116 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 LRRK2Q5S007 2527 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 LY6LH3BQJ8 138 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 HAX1O00165 279 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 ATP6V0E1O15342 81 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1B0GWB2 263 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 IGHV3-11P01762 117 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 NBL1P41271 181 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 H3BMG7 143 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 SAA4P35542 130 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 CT83Q5H943 113 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 SMIM20Q8N5G0 67 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM160Q9NX00 188 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 AGRNO00468 2067 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1W2PPM0 123 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1W2PPR1 153 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 ORMDL3Q8N138 153 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS2-201ENST00000329078 CTSGP08311 255 aa15.46■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 KLK15Q9H2R5 256 aa15.46■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 H3BRM9 83 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 GLMPQ8WWB7 406 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 NPYP01303 97 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 SPINK8P0C7L1 97 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 KLRB1Q12918 225 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 PRR25Q96S07 402 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 INSL3P51460 131 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 IL17RELQ6ZVW7 336 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 SMIM13P0DJ93 91 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 Q6ZQT7 251 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 A0A096LNJ9 63 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 FGF6P10767 208 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 FLNCQ14315 2725 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1B0GW15 77 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 TGFAP01135 160 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 SRD5A1P18405 259 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 OR11H6Q8NGC7 330 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 FOXC2Q99958 501 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 RNF5Q99942 180 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 HBDP02042 147 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 OR5A1Q8NGJ0 315 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 RNF183Q96D59 192 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 ANAPC13Q9BS18 74 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 LEPP41159 167 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 BOD1L2Q8IYS8 172 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 MRAP2Q96G30 205 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 C20orf78Q9BR46 151 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 NPIPB6E9PJ23 425 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 FAM104BQ5XKR9 115 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 F8W735 103 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS2-201ENST00000329078 NEGR1Q7Z3B1 354 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS2-201ENST00000329078 C16orf92Q96LL3 132 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 467.3 ms