RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 K7EN84 100 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 ERVFC1-1P60608 527 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 F6UB75 175 aa14.81□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.81□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 RETNQ9HD89 108 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 V9GYV3 84 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 H3BMM0 161 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 PEX7O00628 323 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 STHQ8IWL8 128 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 TENM3Q9P273 2699 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 IFITM10A6NMD0 228 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 IGLV2-8P01709 118 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 HLA-DRB4P13762 266 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 EPDR1Q9UM22 224 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11B-201ENST00000328024 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 XKRY2A2RUG3 117 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 PSG3Q16557 428 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 BLNKQ8WV28 456 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 CSTL1Q9H114 145 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 NIT2Q9NQR4 276 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 A0A0J9YX75 114 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 MT-ND6P03923 174 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 APOC4P55056 127 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 WDR73Q6P4I2 378 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 BAGE2Q86Y30 109 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF738Q8NE65 137 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 IGKV3-20P01619 116 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA25Q9BR10 227 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 ATG101Q9BSB4 218 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 PGPA6NDG6 321 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 PRAC2D3DTV9 90 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF253O75346 499 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 RANP62826 216 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 RASL11AQ6T310 242 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 FMC1Q96HJ9 113 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 RCHY1Q96PM5 261 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 ZMAT4Q9H898 229 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 OTORQ9NRC9 128 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 UBE2G1P62253 170 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 OR5I1Q13606 314 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 DEFB135Q30KP9 77 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 U3KQK5 164 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 M0R3E3 92 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 PDE6HQ13956 83 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 A8MTW9 85 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 Q6ZWC4 215 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM18Q96B42 140 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 FABP4P15090 132 aa14.71□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 PYY3Q5JQD4 70 aa14.71□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 AMTNQ6UX39 209 aa14.71□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.71□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.71□□□□□ -0.05
RAB11B-201ENST00000328024 FXYD7P58549 80 aa14.7□□□□□ -0.06
RAB11B-201ENST00000328024 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RAB11B-201ENST00000328024 RNF183Q96D59 192 aa14.7□□□□□ -0.06
RAB11B-201ENST00000328024 Q9H3A6 140 aa14.7□□□□□ -0.06
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms