RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 COX8AP10176 69 aa14.98□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.98□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.98□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF738Q8NE65 137 aa14.98□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 NCR2O95944 276 aa14.98□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 IGHG2P01859 326 aa14.98□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.98□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 COX11Q9Y6N1 276 aa14.98□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 CDKN1BP46527 198 aa14.97□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.97□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.97□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 RBX1P62877 108 aa14.96□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 MPV17L2Q567V2 206 aa14.96□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.96□□□□□ -0.01
SPNS1-201ENST00000311008 A6NDX4 124 aa14.96□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 TNFRSF6BO95407 300 aa14.96□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 CACNG7P62955 275 aa14.96□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00477Q96M19 166 aa14.96□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.95□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.95□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 NUDT3O95989 172 aa14.95□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 ATP5J2P56134 94 aa14.95□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.95□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.94□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PSMG4Q5JS54 123 aa14.94□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PIEZO1Q92508 2521 aa14.94□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 OVOL1O14753 267 aa14.94□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.94□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 SNAI2O43623 268 aa14.93□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 MSMBP08118 114 aa14.93□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 FCER1GP30273 86 aa14.93□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa14.93□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 H3BUX3 64 aa14.93□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0G2JLM5 398 aa14.92□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 LY6EQ16553 131 aa14.92□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 DEFB125Q8N687 156 aa14.92□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.92□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.92□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 Q8N8P6 123 aa14.92□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.91□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 FOXE3Q13461 319 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 OR2K2Q8NGT1 345 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 SOCS3O14543 225 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 TRBV12-3P01733 135 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 LEPP41159 167 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 FXYD7P58549 80 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 C20orf173Q96LM9 149 aa14.9□□□□□ -0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PF4V1P10720 104 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 EVI2AP22794 236 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 GATA3P23771 443 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 DSCR9P59020 149 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2V1Q13404 147 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 B4DSR2 109 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 PTTG1IPP53801 180 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 GPHB5Q86YW7 130 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF580Q9UK33 172 aa14.89□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.88□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 IGLV1-40P01703 118 aa14.88□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.88□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 SIVA1O15304 175 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 CD5LO43866 347 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 GAS8-AS1O95177 125 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 FGF6P10767 208 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 MRAP2Q96G30 205 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.87□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 KLK15Q9H2R5 256 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 UFC1Q9Y3C8 167 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV3-11P01762 117 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 BLCAPP62952 87 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 SMPXQ9UHP9 88 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 CACNA1BQ00975 2339 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP6Q13023 2319 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ATP5LO75964 103 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 MED14OSP0DP75 135 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 SEC11AP67812 179 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 PRR9Q5T870 116 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 NRACQ8N912 160 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 H3BVH4 76 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 TAX1BP3O14907 124 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 K7EMT4 169 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 K7EP13 123 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 CCL25O15444 150 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 CFHR3Q02985 330 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 Q6ZVH6 145 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms