RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299441.4

DCHS1-201, Transcript of dachsous cadherin-related 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DCHS1, Length 10,765 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1-201ENST00000299441 RNF5Q99942 180 aa11.2□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.2□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 A0A0G2JRQ6 117 aa11.2□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 SPINK8P0C7L1 97 aa11.2□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 GATA3P23771 443 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 TMEM243Q9BU79 118 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 REG4Q9BYZ8 158 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 SEC11AP67812 179 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 LY6G5BQ8NDX9 201 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 C9JAW5 83 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 TCF15Q12870 199 aa11.19□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 SMPXQ9UHP9 88 aa11.18□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 I3L3M4 83 aa11.18□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 XCL1P47992 114 aa11.18□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.18□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.18□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.18□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.18□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 Q6ZRM9 215 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 NRGNQ92686 78 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 MPZP25189 248 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 CYYR1Q96J86 154 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 WISP1O95388 367 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 GAGE2BQ13066 116 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.17□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 ATP6V0BQ99437 205 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 IGHG3P01860 377 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 MORN5Q5VZ52 161 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 NDUFAF3Q9BU61 184 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 QRFPP83859 136 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 CDKN1BP46527 198 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 UBE2CO00762 179 aa11.16□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 UBE2BP63146 152 aa11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 HAPLN4Q86UW8 402 aa11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 IGHV4-59P01825 116 aa11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.15□□□□□ -0.62
DCHS1-201ENST00000299441 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.15□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 HLA-DRB4P13762 266 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 U3KQA8 63 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 CCL24O00175 119 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 CD5LO43866 347 aa11.14□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 C17orf58Q2M2W7 97 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 SLURP1P55000 103 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF134P52741 427 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 PDE6HQ13956 83 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 MPV17L2Q567V2 206 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 C3orf79P0CE67 100 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 LTBP2Q14767 1821 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.13□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 SPRY2O43597 315 aa11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 WDR86Q86TI4 376 aa11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 FGF16O43320 207 aa11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 NDUFS7O75251 213 aa11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 MMP23AO75900 390 aa11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 CRLF1O75462 422 aa11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 COX11Q9Y6N1 276 aa11.12□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.11□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 SPTBN4Q9H254 2564 aa11.11□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 Q6ZR03 302 aa11.11□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 RS1O15537 224 aa11.11□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.11□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 DSCR8Q96T75 97 aa11.11□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 RMI2Q96E14 147 aa11.11□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.1□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.1□□□□□ -0.63
DCHS1-201ENST00000299441 F6UB75 175 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms