RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 GAGE12GP0CL81 117 aa7.53□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 GAGE12IP0CL82 117 aa7.53□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.53□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 K7ENP7 123 aa7.53□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.53□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 PFN2P35080 140 aa7.53□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.53□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.5□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 XCL2Q9UBD3 114 aa7.5□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 UBE2BP63146 152 aa7.5□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 ZNF503Q96F45 646 aa7.5□□□□□ -1.21
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CUX1-201ENST00000292535 DLEU1O43261 78 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 SMKR1H3BMG3 65 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 Q0VG73 95 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 CEND1Q8N111 149 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-201ENST00000292535 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.49□□□□□ -1.21
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