RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV2-11P01706 119 aa8.38□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 SCGB1A1P11684 91 aa8.38□□□□□ -1.07
GGPS1-201ENST00000282841 C8orf49Q96NF6 230 aa8.38□□□□□ -1.07
GGPS1-201ENST00000282841 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.38□□□□□ -1.07
GGPS1-201ENST00000282841 MAST4O15021 2626 aa8.38□□□□□ -1.07
GGPS1-201ENST00000282841 CD33P20138 364 aa8.37□□□□□ -1.07
GGPS1-201ENST00000282841 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.37□□□□□ -1.07
GGPS1-201ENST00000282841 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.37□□□□□ -1.07
GGPS1-201ENST00000282841 C9JCJ5 164 aa8.37□□□□□ -1.07
GGPS1-201ENST00000282841 K7EQM0 130 aa8.37□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.37□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 DIRC3C9JPN6 131 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 V9GYV3 84 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 VCX2Q9H322 139 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.35□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 Q86TA4 180 aa8.35□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 C20orf173Q96LM9 149 aa8.35□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.35□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.34□□□□□ -1.07
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GGPS1-201ENST00000282841 SIGMAR1Q99720 223 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGPS1-201ENST00000282841 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.32□□□□□ -1.08
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GGPS1-201ENST00000282841 ELANEP08246 267 aa8.32□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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GGPS1-201ENST00000282841 PDE6HQ13956 83 aa8.32□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.32□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 Q8N2B8 174 aa8.32□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.32□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.31□□□□□ -1.08
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GGPS1-201ENST00000282841 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 STAB1Q9NY15 2570 aa8.31□□□□□ -1.08
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