RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 COX19Q49B96 90 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PSMG4Q5JS54 123 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SSX7Q7RTT5 188 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 ZNF114Q8NC26 417 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 C11orf52Q96A22 123 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SLC35E1Q96K37 410 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 ATG101Q9BSB4 218 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PARLQ9H300 379 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 NACAE9PAV3 2078 aa8.51□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 HELTA6NFD8 242 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 EPM2AB3EWF7 344 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 C9JCJ5 164 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SCGB2A1O75556 95 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 CEBPGP53567 150 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 RHOBP62745 196 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 DKK2Q9UBU2 259 aa8.5□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 TRGC2P03986 189 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 TRGC1P0CF51 173 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 CRYBB3P26998 211 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 GALR1P47211 349 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 NDUFA6P56556 154 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 ADIRFQ15847 76 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 TEPPQ6URK8 271 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SLC25A22Q9H936 323 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 ENY2Q9NPA8 101 aa8.49□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 H3BMM0 161 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 GCGP01275 180 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PRCDQ00LT1 54 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PFDN5Q99471 154 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.48□□□□□ -1.05
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SPC25-201ENST00000282074 PAGE4O60829 102 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 C2orf83Q53S99 150 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 LINC01551Q86U37 167 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 FRZBQ92765 325 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 UHRF2Q96PU4 802 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.48□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 CORTO00230 105 aa8.47□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 OR10J4P0C629 311 aa8.47□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.47□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 OR4X1Q8NH49 305 aa8.47□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 MGST2Q99735 147 aa8.47□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SPC25-201ENST00000282074 HLA-DRB4P13762 266 aa8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 TAS2R45P59539 299 aa8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 DAD1P61803 113 aa8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 PKIAP61925 76 aa8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 PYY3Q5JQD4 70 aa8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.46□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PRE2 83 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 CCL18P55774 89 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 SFRP2Q96HF1 295 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 NRN1Q9NPD7 142 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 U3KQE9 123 aa8.45□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 TSTD3H0UI37 97 aa8.44□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 MT-ND6P03923 174 aa8.44□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 GCHFRP30047 84 aa8.44□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.44□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 GLMPQ8WWB7 406 aa8.44□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 TMEM18Q96B42 140 aa8.44□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 SMIM12Q96EX1 92 aa8.44□□□□□ -1.06
SPC25-201ENST00000282074 FUT9Q9Y231 359 aa8.44□□□□□ -1.06
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