RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 TIMD4Q96H15 378 aa8.56□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV3-15P01624 115 aa8.56□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.56□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.56□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 Q8TAT8 98 aa8.56□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 CCL19Q99731 98 aa8.56□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 A0A096LNJ9 63 aa8.55□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.55□□□□□ -1.04
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CNGA3-201ENST00000272602 MYCNOSP40205 109 aa8.55□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.55□□□□□ -1.04
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CNGA3-201ENST00000272602 IL4P05112 153 aa8.55□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 GP9P14770 177 aa8.55□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.55□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.55□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 C17orf100A8MU93 164 aa8.55□□□□□ -1.04
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CNGA3-201ENST00000272602 IGLL5B9A064 214 aa8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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CNGA3-201ENST00000272602 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.54□□□□□ -1.04
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CNGA3-201ENST00000272602 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 F8W1H4 67 aa8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 SIVA1O15304 175 aa8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 CNTFRP26992 372 aa8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.54□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 PSMB2P49721 201 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 CEND1Q8N111 149 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 RPEQ96AT9 228 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 MC5RP33032 325 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 MRAP2Q96G30 205 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 DPM2O94777 84 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 LY6EQ16553 131 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 C12orf74Q32Q52 190 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.53□□□□□ -1.04
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CNGA3-201ENST00000272602 FBXL15Q9H469 300 aa8.53□□□□□ -1.04
CNGA3-201ENST00000272602 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.53□□□□□ -1.04
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CNGA3-201ENST00000272602 J3QKU1 62 aa8.52□□□□□ -1.05
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CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP10-9P60411 292 aa8.52□□□□□ -1.05
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CNGA3-201ENST00000272602 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1B0GW15 77 aa8.52□□□□□ -1.05
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CNGA3-201ENST00000272602 GLMPQ8WWB7 406 aa8.52□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 PTH2Q96A98 100 aa8.52□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.52□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.51□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 GAS8-AS1O95177 125 aa8.51□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 CRIP1P50238 77 aa8.51□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 Q6AWC8 147 aa8.51□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.51□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.51□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.51□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.51□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PPR1 153 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 J3KRW8 73 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV3-23P01764 117 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 NF1P21359 2839 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 OR11H12B2RN74 326 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 FSTL3O95633 263 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 OR11H1Q8NG94 326 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 OR11H2Q8NH07 326 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 RNF223E7ERA6 249 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV2-11P01706 119 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.49□□□□□ -1.05
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