RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 VGLL1Q99990 258 aa9.15□□□□□ -0.94
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PRX2 142 aa9.15□□□□□ -0.94
CLSTN3-201ENST00000266546 H7C1H1 209 aa9.15□□□□□ -0.94
CLSTN3-201ENST00000266546 FSTL3O95633 263 aa9.15□□□□□ -0.94
CLSTN3-201ENST00000266546 PCP2Q8IVA1 136 aa9.15□□□□□ -0.94
CLSTN3-201ENST00000266546 DDB2Q92466 427 aa9.15□□□□□ -0.94
CLSTN3-201ENST00000266546 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.15□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 K7ERJ3 54 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 NPYP01303 97 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 PAX1P15863 534 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 PATE2Q6UY27 113 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 DKK2Q9UBU2 259 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 H3BMG7 143 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 GTSF1Q8WW33 167 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 RNF114Q9Y508 228 aa9.14□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 NDUFS7O75251 213 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 DTX2Q86UW9 622 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 C3orf56Q8N813 242 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 PROP1O75360 226 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF503Q96F45 646 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 PLXNB1O43157 2135 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 IGLV2-8P01709 118 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 GAGE2BQ13066 116 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 GAGE2EQ4V326 116 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 CNTFRP26992 372 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 AMTNQ6UX39 209 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 ATP6V0BQ99437 205 aa9.13□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.12□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.12□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.12□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 PRTN3P24158 256 aa9.12□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 RNF223E7ERA6 249 aa9.12□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC00310P59036 64 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 PRR25Q96S07 402 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 TRGV3P03979 118 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 KLRD1Q13241 179 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 CEND1Q8N111 149 aa9.11□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 SRD5A1P18405 259 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 IGHV4-39P01824 125 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 Q8N8P6 123 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 C17orf77Q96MU5 243 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 ERG28Q9UKR5 140 aa9.1□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1B0GXF2 115 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 IGKV3-20P01619 116 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 GP9P14770 177 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 ERCC8Q13216 396 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 C15orf32Q32M92 178 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 CTSZQ9UBR2 303 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 HCFC1P51610 2035 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 TSPAN13O95857 204 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 CGB3P0DN86 165 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 CGB7P0DN87 165 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 GLMPQ8WWB7 406 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 MRAP2Q96G30 205 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 H3BRN7 92 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 SZT2Q5T011 3432 aa9.09□□□□□ -0.95
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC01549A6NIU2 74 aa9.09□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC25A16P16260 332 aa9.09□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 C22orf46C9J442 243 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 G3V4G9 280 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 TAL2Q16559 108 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 C12orf74Q32Q52 190 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 MBD6Q96DN6 1003 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.08□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 B4DSR2 109 aa9.07□□□□□ -0.96
CLSTN3-201ENST00000266546 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms