RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SGK494Q96LW2 274 aa15.84■□□□□ 0.13
SYF2-201ENST00000236273 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SYF2-201ENST00000236273 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.83■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 LCE6AA0A183 80 aa15.83■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 UBE2G2P60604 165 aa15.83■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.83■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 FAM213BQ8TBF2 198 aa15.83■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 LYRM9A8MSI8 78 aa15.82■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 CCDC28AQ8IWP9 274 aa15.82■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 VPS13DQ5THJ4 4388 aa15.81■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa15.81■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa15.81■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 Q6AWC8 147 aa15.81■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 SLC51BQ86UW2 128 aa15.81■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.81■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 C2CD4CQ8TF44 421 aa15.81■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 SFT2D1Q8WV19 159 aa15.81■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.8■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa15.8■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 LINC00479Q96M42 142 aa15.8■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.8■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 ZFP69Q49AA0 526 aa15.79■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.79■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 ATG101Q9BSB4 218 aa15.79■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 PSG8Q9UQ74 426 aa15.79■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 LINC00612Q8N6U2 182 aa15.78■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 APLNQ9ULZ1 77 aa15.78■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GV50 99 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 IGLL5B9A064 214 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 H2AFB1P0C5Y9 115 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 SULT1A2P50226 295 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 DAD1P61803 113 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 CCL20P78556 96 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 TMEM75Q8N9X5 138 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 TREM1Q9NP99 234 aa15.77■□□□□ 0.12
SYF2-201ENST00000236273 TRAV34A0A0B4J273 112 aa15.76■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 F6UZH7 168 aa15.76■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 C8orf49Q96NF6 230 aa15.76■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.76■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15.76■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 PEX7O00628 323 aa15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 PAGE4O60829 102 aa15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 IFNA7P01567 189 aa15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 DEFB130BP0DP73 79 aa15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 DEFB130AP0DP74 79 aa15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 ATP5G3P48201 142 aa15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 RAB5CP51148 216 aa15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 CBY3A6NI87 242 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 K7EQM0 130 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 RGS13O14921 159 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 MUC21Q5SSG8 566 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 PRNTQ86SH4 94 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 LINC00476Q8WZB0 136 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H2BAQ96A08 127 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 KLF12Q9Y4X4 402 aa15.74■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa15.73■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.73■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 TCL1AP56279 114 aa15.72■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 TCTAP57738 103 aa15.72■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 TDRG1Q3Y452 100 aa15.72■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 CST9LP1Q5W188 147 aa15.72■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.72■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.72■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 SNURFLB1AK76 121 aa15.71■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZTI0 123 aa15.71■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 MDFICQ9P1T7 246 aa15.71■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 KMT2AQ03164 3969 aa15.71■□□□□ 0.11
SYF2-201ENST00000236273 TRAV21A0A0B4J279 112 aa15.7■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 HTN3P15516 51 aa15.7■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 NDFIP1Q9BT67 221 aa15.7■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 GNRH2O43555 120 aa15.69■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 SPINK4O60575 86 aa15.69■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL7Q9BRU2 100 aa15.69■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 GAGE12BA1L429 117 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 GAGE7O76087 117 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 GCGP01275 180 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 GAGE12FP0CL80 117 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 GAGE12GP0CL81 117 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 GAGE12IP0CL82 117 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 Q86TA4 180 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 ATP5G1P05496 136 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 TMEM183BQ1AE95 376 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 SMUG1Q53HV7 270 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 LGALS9CQ6DKI2 356 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 COX8CQ7Z4L0 72 aa15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms