RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GW15 77 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 SNURFLB1AK76 121 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 M0QZ24 198 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 ERCC8Q13216 396 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.19□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 LINC01006Q8NI28 216 aa7.19□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 HBBP68871 147 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 FHL3Q13643 280 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.18□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.18□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 K7EQG2 157 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 SPINK4O60575 86 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 APCSP02743 223 aa7.17□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 EDN2P20800 178 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 Q0VG73 95 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 RIGQ13278 110 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.17□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.17□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 ZFHX3Q15911 3703 aa7.17□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 IGLC6P0CF74 106 aa7.16□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 SLURP1P55000 103 aa7.16□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF575Q86XF7 245 aa7.16□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 RAB4BP61018 213 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 PAFAH1B2P68402 229 aa7.15□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC1-201ENST00000229304 F2Z2F3 143 aa7.14□□□□□ -1.27
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APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.14□□□□□ -1.27
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APOBEC1-201ENST00000229304 RAX2Q96IS3 184 aa7.14□□□□□ -1.27
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APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.13□□□□□ -1.27
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APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GUS0 222 aa7.13□□□□□ -1.27
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APOBEC1-201ENST00000229304 KLLNB2CW77 178 aa7.13□□□□□ -1.27
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APOBEC1-201ENST00000229304 S100A2P29034 98 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC1-201ENST00000229304 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC1-201ENST00000229304 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC1-201ENST00000229304 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC1-201ENST00000229304 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC1-201ENST00000229304 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.13□□□□□ -1.27
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