RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055131.12

Usp48-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp48, Length 5,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48-201ENSMUST00000055131 Igkv4-86A0A0G2JGE7 114 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm37797A0A1D5RLC8 261 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sp9Q64HY3 484 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21976J3QNN2 249 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 P01783 136 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prss33Q80WM7 277 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1259Q8VEZ1 309 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 F8Q06194 2319 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 PpoxP51175 477 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 CortP56469 109 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem140Q8BGY5 185 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm9945Q8BNZ3 91 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mbnl3Q8R003 342 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trbv15A0A0A6YYE3 115 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn1r1E9PVR6 306 aa14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr954Q9EQB6 314 aa14.74□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm45783A0A1B0GT48 74 aa14.74□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 E030025P04RikA2A6V5 185 aa14.74□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cd8bP10300 213 aa14.74□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr149Q60888 311 aa14.74□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 BC030500E9Q6W0 185 aa14.74□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Leprotl1Q9CQ74 131 aa14.74□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prss8Q9ESD1 342 aa14.74□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cdx1P18111 268 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 LalbaP29752 143 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hmga2P52927 108 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr195Q8VGQ6 308 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gng4P50153 75 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1382Q7TQT3 311 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ccr6O54689 367 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Efnb1P52795 345 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tac3P55099 116 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem42Q9CR22 157 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr902E9Q6Z7 309 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm17430F6RSK3 157 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 4930412O13RikQ9D5M9 106 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem160Q9D938 188 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr175-ps1A0A140T8K4 308 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ifi27Q8C6G0 260 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem139E9PX92 214 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ankrd66J3QNN4 192 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cd3eP22646 189 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pef1Q8BFY6 275 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ifitm10Q8BR26 201 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1173Q7TR24 312 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr275Q7TS18 319 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Chchd1Q9CQA6 118 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm6525A0A0A6YW33 106 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21882J3QN86 361 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700013G24RikQ9DAC6 286 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cbln1Q9R171 193 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Igkv9-124A0A0G2JDR3 117 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1192-ps1A0A1L1SRD7 309 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr556E9Q549 324 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rps20P60867 119 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Znf641Q8BZ34 422 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 CrhQ8CIT0 187 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 D1Ertd622eQ8VEB3 207 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Bpifa5Q9CQX3 270 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem183Q9JJB9 375 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Spint5J3KMK8 105 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tcrg-V1P06325 135 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Wnt5bP22726 359 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hhipl1Q14DK5 791 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr553Q7TRS6 326 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Acsm5Q8BGA8 578 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Srd5a2Q99N99 254 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dppa2Q9CWH0 301 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm45844A0A1B0GRQ2 137 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Csf2rb2P26954 878 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 GaptQ8CB93 157 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Lrrc25Q8K1T1 297 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tspan2Q922J6 221 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 AmtnQ9D3J8 213 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 H2al3Q9D4U4 128 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm6970F7DCP6 221 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Plp1P60202 277 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Duxbl2Q7TNE6 350 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Arl6ip6Q8BH07 226 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Q9CQM1 111 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ankrd12G5E893 2041 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 PspnO70300 156 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cr2P19070 1025 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Foxa2P35583 459 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc25a16Q8C0K5 332 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fndc7A2AED3 737 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm20873J3QMQ9 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm20795J3QP49 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21440Q3TTD8 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 B020031M17RikQ3UT11 173 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zfp677Q6PEP4 634 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 D830044I16RikA0A1D5RM53 117 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Htr1dQ61224 374 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 99.5 ms